當前，以PacBio、Nanopore為代表的三代測序技術(shù)已成為全基因組測序（WGS）的主流方法。利用無需PCR過程的單分子測序技術(shù)，進行長讀長測序，無論是對基因組組裝還是基因組變異檢測，都具有很高的準確率。更可利用測序過程中聚合酶反應(yīng)的動力學變化，分析基因組學和表觀遺傳學數(shù)據(jù)，適合于基于多組學研究的應(yīng)用場景。

結(jié)合當前大力發(fā)展中醫(yī)藥研究及產(chǎn)業(yè)化的時代大背景，基于全基因組測序及多組學研究的技術(shù)，已經(jīng)成為了中醫(yī)藥科學研究的重要推動力。日前，來自醫(yī)科大學、中醫(yī)科學院道地藥材重點實驗室、以及安諾優(yōu)達的聯(lián)合團隊利用PacBio三代測序技術(shù)，發(fā)表了一個染色體水平的高質(zhì)量三七參考基因組，并通過基因組演化分析，鑒定了系統(tǒng)發(fā)育與全基因組復(fù)制事件對于皂苷合成的影響。

三七是五加科人參屬的多年生草本植物，因其廣泛的藥理學作用，在中國近千年的臨床治療中發(fā)揮了重要的作用。結(jié)合多組學研究數(shù)據(jù)，研究人員還對三七進行了詳細的轉(zhuǎn)錄水平分析，揭示了三七的小塊莖形成的基因調(diào)控機制，從時間和空間水平上，進一步研究了皂苷的合成和調(diào)控。鑒定到了5個糖基轉(zhuǎn)移酶基因，在三七中催化不同的人參皂苷的形成。

文章中所報道的三七全基因組數(shù)據(jù)為將來進一步研究三七生長特性、栽培、育種以及皂苷合成提供了遺傳數(shù)據(jù)資源。這一成果發(fā)表于核心期刊《Plant Communications》。

三代全基因組測序?qū)蚪MDNA的濃度、純度有較高要求，只有質(zhì)量合格的樣品才能進入測序流程，否則將導(dǎo)致錯誤的產(chǎn)生。   

本文中樣品質(zhì)控使用了Implen的Nanophotometer?及Qubit 2.0，分別對提取的基因組DNA進行純度及濃度檢測。A260/A280、A260/A230方法為核酸樣品質(zhì)控的通用方法，同時也是目前的標準方法。Nanophotometer?可以準確的測量A260/A280和A260/A230，提供完整的DNA純度數(shù)據(jù)，完全符合期刊對于數(shù)據(jù)完整性的要求。

這得益于設(shè)備高精度的光學結(jié)構(gòu)，在全波長掃描下可同時獲得全波長數(shù)據(jù)。無論是NGS，三代測序，還是QPCR，DNA還是RNA，Nanophotometer?都可以令您得心應(yīng)手，助力您的科學研究。

如果您使用基因測序作為研究手段，可根據(jù)通量需求選擇Implen的N60或N120系列，實現(xiàn)對少量或大量核酸樣本的質(zhì)控。N60作為單通道設(shè)備，性能出眾，操作便捷；N120可一次測量12個樣品，得到準確結(jié)果。二者均具有很好的波長精度，適合多波長測量下的比值數(shù)據(jù)獲取。

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