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    產(chǎn)品應(yīng)用|Varioskan LUX多功能酶標(biāo)儀在NanoBRET?分析中的適用性驗(yàn)證及條件優(yōu)化指南

    在探索生命奧秘的征途上,蛋白質(zhì)-相互作用(PPI)的研究至關(guān)重要。傳統(tǒng)的BRET(生物發(fā)光共振能量轉(zhuǎn)移)技術(shù)曾是研究細(xì)胞動(dòng)態(tài)事件的有力工具,但其應(yīng)用卻常常受限。


    PART.01
    背景介紹




    傳統(tǒng)BRET技術(shù)的局限性

    生物發(fā)光共振能量轉(zhuǎn)移(BRET)檢測(cè)試劑盒由Promega在20世紀(jì)90年代末開發(fā),對(duì)于理解細(xì)胞動(dòng)態(tài)事件至關(guān)重要,特別是蛋白相互作用(PPI)。在BRET中,發(fā)光供體的激發(fā)態(tài)能量可以轉(zhuǎn)移到受體熒光素,導(dǎo)致受體分子以特征發(fā)射波長(zhǎng)發(fā)出。這些類型的檢測(cè)試劑盒迅速成為測(cè)量PPI的有用工具,它們不僅被認(rèn)為是通用的、快速的和生物學(xué)上有用的,而且也適合用于PPI調(diào)節(jié)的活細(xì)胞藥物發(fā)現(xiàn)的高通量篩選。然而,傳統(tǒng)的BRET技術(shù)存在一些局限性:


    信號(hào)強(qiáng)度低:由于BRET供體 (如RLuc/RLuc8) 信號(hào)強(qiáng)度較低,限制了檢測(cè)的靈敏度。

    對(duì)高表達(dá)水平的依賴:傳統(tǒng)方法通常需要高水平的供體表達(dá),這可能與生物學(xué)相關(guān)性不符,并可能因?yàn)楦咚降挠坞x供體導(dǎo)致高背景信號(hào)。

    細(xì)胞系限制:BRET檢測(cè)試劑盒僅限于易于轉(zhuǎn)染的細(xì)胞系,并強(qiáng)烈依賴于受體分子的選擇,以確保最大化光譜重疊。




    NanoBRET?技術(shù)的革新

    Promega公司推出的NanoBRET?消除了所有的限制。在NanoBRET?中,可以使用一種新的、效率高得多的供體-受體對(duì)來(lái)研究PPI(見圖1)。這一新組合包括一個(gè)非常亮的熒光素酶(NanoLuc)作為能量供體,以及一個(gè)用熒光標(biāo)記的Halotag融合蛋白作為能量受體。

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    圖 1. NanoBRET?檢測(cè)

    A中:使用NanoBRET研究蛋?質(zhì)A和B之間的相互作用。供體是NanoLuc??蛋?質(zhì)A融合體,受體是熒光標(biāo)記的HaloTag??蛋?質(zhì)B融合體。

    B中:顯示了NanoBRET的分離光譜和計(jì)算方法。



    更高的效率

    新的供體(NanoLuc)尺寸小(19kD),發(fā)射信號(hào)強(qiáng)(460nm發(fā)射峰),并且發(fā)射光譜較窄,降低了供體信號(hào)“溢漏”到受體發(fā)射通道的可能性。



    更高的信噪比

    選擇紅色熒光素酶作為BRET配體 (618nm發(fā)射) 通過共價(jià)鍵連接到HaloTag,這允許相當(dāng)大的光譜分離(超過150nm),從而確保非常高的信噪比。




    Varioskan LUX與NanoBRET?的完美結(jié)合

    然而,盡管比典型的BRET檢測(cè)方法優(yōu)越,NanoBRET的性能仍然取決于選擇合適的酶標(biāo)儀。Promega強(qiáng)烈建議使用能夠測(cè)量雙濾光片波長(zhǎng)的儀器,Thermo Scientific Varioskan LUX多功能酶標(biāo)儀具備測(cè)量雙濾光片波長(zhǎng)的能力,非常適合進(jìn)行NanoBRET?檢測(cè)。







    儀器與配件

    選擇次優(yōu)濾光片可能會(huì)損害試驗(yàn)性能并降低數(shù)據(jù)質(zhì)量。根據(jù)Promega的說法,理想情況下供體信號(hào)應(yīng)該用中心波長(zhǎng)為460nm的帶通濾光片(BP)和一個(gè)從600-610nm開始的長(zhǎng)通濾光片(LP)來(lái)測(cè)量,以收集所有受體發(fā)射信號(hào)。使用適當(dāng)?shù)腖P濾光片收集受體信號(hào)對(duì)于確保檢測(cè)試劑的靈敏度尤為重要。







    試劑與材料

    96孔板和384孔板,1X PBS/0.1%BSA,NanoBRET?控制蛋白組,NanoBRET? Nano-Glo?底物。







    實(shí)驗(yàn)設(shè)置

    化學(xué)發(fā)光共振能量轉(zhuǎn)移(NanoBRET)試驗(yàn)

    用1X PBS/0.1%BSA稀釋NanoBRET Nano-Glo底物,稀釋250倍制備成2X溶液。將不同濃度的反應(yīng)液每孔加50μl,并加入等量的2X NanoBRET Nano-Glo底物 (50μl)。最后一種試劑用Varioskan LUX添加。在加入底物后10分鐘內(nèi),使用Varioskan LUX和選擇的濾光片檢測(cè)供體和受體發(fā)射光信號(hào)。

    Varioskan LUX 的NanoBRET實(shí)驗(yàn)設(shè)置

    儀器啟動(dòng)前,需要安裝適當(dāng)?shù)臑V光片。為此,請(qǐng)按照儀器手冊(cè)中的說明將濾光片安裝到Varioskan LUX中。需要注意的是,在安裝F600LP或F610LP濾光片時(shí),即使這些濾光片沒有波長(zhǎng)范圍,也必須在Thermo Scientific SkanIt?軟件中定義一個(gè)波長(zhǎng)范圍,可以設(shè)置600-999nm。


    編輯SkanIt程序

    添加一個(gè)動(dòng)力學(xué)環(huán),選擇總時(shí)間(或讀數(shù)次數(shù))和動(dòng)力學(xué)間隔。在此測(cè)試中,以1分鐘為間隔進(jìn)行20次讀數(shù)。注意:反應(yīng)開始后的前10分鐘內(nèi),受體和供體發(fā)射信號(hào)的動(dòng)力學(xué)衰減非常顯著(如圖2所示)。然而,供體和受體信號(hào)的衰減速度保持不變,因此在較長(zhǎng)的測(cè)量時(shí)間內(nèi)計(jì)算出的NanoBRET比值不會(huì)受到影響。


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    圖2

    在動(dòng)力循環(huán)中添加一個(gè)分液步驟

    在本次案例中,在讀數(shù)為1時(shí)用中高速自動(dòng)分液50μl NanoBRET Nano-Glo底物。

    在動(dòng)力循環(huán)中添加一個(gè)用濾光片測(cè)量化學(xué)發(fā)光的步驟

    選擇用于測(cè)量NanoBRET的濾光片對(duì),并設(shè)置1000毫秒的測(cè)量時(shí)間,使用自動(dòng)增益。


    注意:通常情況下,改變?cè)鲆嬉栽鰪?qiáng)受體發(fā)射信號(hào)并不能改善NanoBRET結(jié)果(改變?cè)鲆鏁?huì)同時(shí)放大信號(hào)和背景噪聲)。然而,在受體發(fā)射信號(hào)飽和的情況下,可以降低增益以獲得非飽和讀數(shù)。

    添加化學(xué)發(fā)光光譜步驟(可選)

    在0%濃度(沒有nanoBRET信號(hào))和100%濃度(最大nanoBRET信號(hào))的孔中測(cè)量受體和發(fā)射光譜。使用波長(zhǎng)范圍為400–700nm(以1nm步進(jìn)),測(cè)量時(shí)間為100ms。


    PART.02
    數(shù)據(jù)處理與結(jié)果




    數(shù)據(jù)處理



    通過將受體發(fā)射信號(hào)值除以供體發(fā)射信號(hào)值(Acceptor Em/Donor Em)來(lái)計(jì)算每個(gè)樣本的NanoBRET比值。


    通過從樣品中減去對(duì)照(無(wú)相互作用)的NanoBRET比值來(lái)計(jì)算校正后的NanoBRET比值。


    對(duì)校正后的 NanoBRET 比值與濃度的依賴關(guān)系進(jìn)行線性回歸分析,并計(jì)算曲線的斜率。


    如果儀器正確地檢測(cè)到NanoBRET信號(hào),應(yīng)該獲得一條線性曲線。使用以下公式計(jì)算定量限(LOQ)和檢測(cè)限(LOD)。注意:無(wú)相互作用對(duì)照(下圖)對(duì)應(yīng)于0%濃度樣本。

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    使用NanoBRET比值的均值和標(biāo)準(zhǔn)差來(lái)計(jì)算每個(gè)濃度篩選窗口系數(shù)值(Z’)以評(píng)估該檢測(cè)方法在各個(gè)濃度下的性能:

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    實(shí)驗(yàn)結(jié)果


    使用Promega控制蛋白組進(jìn)行的NanoBRET檢測(cè)顯示,在96孔板中,使用兩種不同的發(fā)射濾光片收集受體信號(hào)時(shí),Varioskan LUX 檢測(cè)到的NanoBRET信號(hào)保持線性(圖3)。

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    圖3


    當(dāng)使用波長(zhǎng)為600或610nm濾光片收集受體信號(hào)時(shí),儀器性能指標(biāo)LOQ和LOD值也高度相似(表1)。使用Varioskan LUX,兩種情況下的LOQ濃度都在0.2%左右,表明相對(duì)于總供體群體,含有0.2%供體受體(BRET)對(duì)的樣本從統(tǒng)計(jì)上與只含有供體分子的樣本區(qū)分開來(lái)。


    NanoBRET是一種出色的篩選工具。根據(jù)這里獲得的結(jié)果,還可以得出結(jié)論:在1%最大NanoBRET效率下進(jìn)行篩選優(yōu)化,無(wú)論Varioskan LUX測(cè)量時(shí)采用哪個(gè)NanoBRET受體發(fā)射濾光片(600或610nm),都可以產(chǎn)生極好的質(zhì)量參數(shù)(Z' > 0.8)。

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    當(dāng)在384孔板中運(yùn)行時(shí),該分析方法也表現(xiàn)良好。在這種情況下測(cè)量的最低檢出限 (LOD) 只輕微增加到0.35%(圖4)。這使得NanoBRET和Varioskan LUX的結(jié)合對(duì)于大型化學(xué)抑制劑篩選受體供體對(duì)的檢測(cè)非常有用。

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    圖4


    PART.03
    結(jié)論


    在Varioskan LUX中選擇多重化學(xué)發(fā)光檢測(cè)濾光片,可實(shí)現(xiàn)NanoBRET 的性能,這是一種由Promega開發(fā)的技術(shù),非常適合對(duì)活細(xì)胞中的蛋白質(zhì)相互作用進(jìn)行動(dòng)態(tài)研究。我們建議使用中心波長(zhǎng)約為460nm(發(fā)射波長(zhǎng)為450nm,帶寬為80nm)的帶通 (BP) 濾光片測(cè)量供體發(fā)射信號(hào),使用起始波長(zhǎng)為600或610nm的長(zhǎng)通 (LP) 濾光片測(cè)量受體發(fā)射信號(hào)。


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